MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Spirochaeta coccoides DSM 17374 chromosome

Total Repeats: 44851

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_015436	A	6	6	6	11	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_015436	TA	3	6	35	40	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_015436	AGT	2	6	50	55	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_015436	ATG	2	6	105	110	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_015436	GAA	2	6	125	130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
6	NC_015436	ATT	2	6	132	137	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835984
7	NC_015436	CTGG	2	8	145	152	0 %	25 %	50 %	25 %	330835984
8	NC_015436	GCC	3	9	230	238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835984
9	NC_015436	TTCC	2	8	258	265	0 %	50 %	0 %	50 %	330835984
10	NC_015436	CAT	2	6	316	321	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
11	NC_015436	TCA	2	6	360	365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
12	NC_015436	GAT	2	6	410	415	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
13	NC_015436	GAA	2	6	416	421	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
14	NC_015436	AACGA	2	10	422	431	60 %	0 %	20 %	20 %	330835984
15	NC_015436	GCAA	2	8	488	495	50 %	0 %	25 %	25 %	330835984
16	NC_015436	CT	3	6	504	509	0 %	50 %	0 %	50 %	330835984
17	NC_015436	GA	3	6	534	539	50 %	0 %	50 %	0 %	330835984
18	NC_015436	GGCCAT	2	12	562	573	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	330835984
19	NC_015436	GAA	2	6	577	582	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
20	NC_015436	GGA	2	6	617	622	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835984
21	NC_015436	AAT	2	6	677	682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835984
22	NC_015436	GTC	2	6	695	700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835984
23	NC_015436	AAG	2	6	752	757	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
24	NC_015436	TTC	2	6	795	800	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835984
25	NC_015436	GAT	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
26	NC_015436	TCC	2	6	819	824	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835984
27	NC_015436	GAA	2	6	845	850	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
28	NC_015436	AGC	2	6	888	893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
29	NC_015436	GCA	2	6	951	956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
30	NC_015436	TCCT	2	8	984	991	0 %	50 %	0 %	50 %	330835984
31	NC_015436	GAT	2	6	1058	1063	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
32	NC_015436	TCA	2	6	1074	1079	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
33	NC_015436	CCAGCC	2	12	1218	1229	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	330835984
34	NC_015436	CAT	2	6	1243	1248	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
35	NC_015436	GTA	2	6	1253	1258	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835984
36	NC_015436	ACG	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835984
37	NC_015436	GAA	2	6	1297	1302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835984
38	NC_015436	GGA	2	6	1397	1402	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835984
39	NC_015436	CATG	2	8	1420	1427	25 %	25 %	25 %	25 %	330835984
40	NC_015436	TCA	2	6	1491	1496	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835984
41	NC_015436	ACTA	2	8	1521	1528	50 %	25 %	0 %	25 %	330835984
42	NC_015436	CAT	2	6	1584	1589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_015436	T	7	7	1597	1603	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_015436	GTT	2	6	1608	1613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_015436	GTT	2	6	1660	1665	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_015436	T	6	6	1678	1683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_015436	TG	3	6	1717	1722	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_015436	TAT	2	6	1724	1729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_015436	TACTAT	2	12	1730	1741	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_015436	AAG	2	6	1751	1756	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_015436	TAA	3	9	1759	1767	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_015436	CCA	2	6	1802	1807	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835985
53	NC_015436	CTTG	2	8	1899	1906	0 %	50 %	25 %	25 %	330835985
54	NC_015436	ATTCC	2	10	1935	1944	20 %	40 %	0 %	40 %	330835985
55	NC_015436	GAA	2	6	1966	1971	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
56	NC_015436	CCA	2	6	1976	1981	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835985
57	NC_015436	T	6	6	1985	1990	0 %	100 %	0 %	0 %	330835985
58	NC_015436	TCC	2	6	2009	2014	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330835985
59	NC_015436	GAA	2	6	2044	2049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
60	NC_015436	A	7	7	2048	2054	100 %	0 %	0 %	0 %	330835985
61	NC_015436	GAA	2	6	2137	2142	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
62	NC_015436	TTC	2	6	2158	2163	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835985
63	NC_015436	GCG	2	6	2246	2251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835985
64	NC_015436	AATAC	2	10	2261	2270	60 %	20 %	0 %	20 %	330835985
65	NC_015436	CAG	2	6	2271	2276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835985
66	NC_015436	TCA	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
67	NC_015436	GAC	2	6	2300	2305	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835985
68	NC_015436	TCTT	2	8	2307	2314	0 %	75 %	0 %	25 %	330835985
69	NC_015436	GA	3	6	2320	2325	50 %	0 %	50 %	0 %	330835985
70	NC_015436	AGA	2	6	2331	2336	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835985
71	NC_015436	TCA	2	6	2360	2365	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
72	NC_015436	GGA	2	6	2461	2466	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835985
73	NC_015436	GAG	2	6	2662	2667	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835985
74	NC_015436	ATT	2	6	2846	2851	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330835985
75	NC_015436	ATC	2	6	2857	2862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835985
76	NC_015436	TGA	2	6	2893	2898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835985
77	NC_015436	CATT	2	8	2915	2922	25 %	50 %	0 %	25 %	330835986
78	NC_015436	TCG	2	6	2977	2982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835986
79	NC_015436	T	6	6	3008	3013	0 %	100 %	0 %	0 %	330835986
80	NC_015436	TCG	2	6	3115	3120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835986
81	NC_015436	ATC	2	6	3133	3138	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835986
82	NC_015436	AGAAA	2	10	3189	3198	80 %	0 %	20 %	0 %	330835986
83	NC_015436	TA	4	8	3218	3225	50 %	50 %	0 %	0 %	330835986
84	NC_015436	ATG	2	6	3250	3255	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
85	NC_015436	CGC	2	6	3288	3293	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835986
86	NC_015436	GACCA	2	10	3303	3312	40 %	0 %	20 %	40 %	330835986
87	NC_015436	GAT	2	6	3339	3344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
88	NC_015436	GAAG	2	8	3389	3396	50 %	0 %	50 %	0 %	330835986
89	NC_015436	GCC	2	6	3471	3476	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835986
90	NC_015436	GAA	2	6	3594	3599	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835986
91	NC_015436	GAC	2	6	3638	3643	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835986
92	NC_015436	GTG	2	6	3649	3654	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835986
93	NC_015436	CAGG	2	8	3756	3763	25 %	0 %	50 %	25 %	330835986
94	NC_015436	CTT	2	6	3764	3769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
95	NC_015436	TTC	2	6	3796	3801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
96	NC_015436	GAT	2	6	3807	3812	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835986
97	NC_015436	CTTG	2	8	3815	3822	0 %	50 %	25 %	25 %	330835986
98	NC_015436	TTTC	2	8	3849	3856	0 %	75 %	0 %	25 %	330835986
99	NC_015436	TTC	2	6	3882	3887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
100	NC_015436	TTCC	2	8	3891	3898	0 %	50 %	0 %	50 %	330835986
101	NC_015436	GAA	2	6	3900	3905	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835986
102	NC_015436	TTC	2	6	3914	3919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835986
103	NC_015436	AGG	2	6	3956	3961	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	330835986
104	NC_015436	ACAGGA	2	12	3982	3993	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	330835987
105	NC_015436	CTT	2	6	4021	4026	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330835987
106	NC_015436	TGT	2	6	4029	4034	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835987
107	NC_015436	ATAA	2	8	4271	4278	75 %	25 %	0 %	0 %	330835987
108	NC_015436	T	6	6	4394	4399	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_015436	ATTT	2	8	4423	4430	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_015436	CAA	2	6	4449	4454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835988
111	NC_015436	CGG	2	6	4530	4535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835988
112	NC_015436	GAA	2	6	4572	4577	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835988
113	NC_015436	A	7	7	4595	4601	100 %	0 %	0 %	0 %	330835988
114	NC_015436	AAG	2	6	4610	4615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835988
115	NC_015436	GAAA	2	8	4662	4669	75 %	0 %	25 %	0 %	330835989
116	NC_015436	AAC	2	6	4718	4723	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835989
117	NC_015436	GTC	2	6	4730	4735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835989
118	NC_015436	GGC	2	6	4803	4808	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	330835989
119	NC_015436	ACT	2	6	4868	4873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835989
120	NC_015436	CAAA	2	8	4886	4893	75 %	0 %	0 %	25 %	330835989
121	NC_015436	CAT	2	6	4979	4984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_015436	TA	3	6	5023	5028	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_015436	ATG	2	6	5107	5112	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835990
124	NC_015436	GCC	2	6	5125	5130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	330835990
125	NC_015436	GAA	2	6	5176	5181	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
126	NC_015436	GAA	2	6	5293	5298	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	330835990
127	NC_015436	TCA	3	9	5300	5308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330835990
128	NC_015436	GGT	2	6	5431	5436	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330835990
129	NC_015436	GTC	2	6	5515	5520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	330835990
130	NC_015436	GACG	2	8	5527	5534	25 %	0 %	50 %	25 %	330835990
131	NC_015436	CCCT	2	8	5537	5544	0 %	25 %	0 %	75 %	330835990
132	NC_015436	TTTG	2	8	5595	5602	0 %	75 %	25 %	0 %	330835990
133	NC_015436	CCA	2	6	5618	5623	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	330835990
134	NC_015436	AAT	2	6	5659	5664	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330835990
135	NC_015436	GAC	2	6	5799	5804	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	330835990
136	NC_015436	TGA	2	6	5901	5906	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835990
137	NC_015436	ACA	2	6	6029	6034	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	330835990
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248	NC_015436	A	6	6	11441	11446	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_015436	TGAT	2	8	11458	11465	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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251	NC_015436	TGGA	2	8	11506	11513	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
252	NC_015436	GCAT	2	8	11519	11526	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
253	NC_015436	GAA	2	6	11532	11537	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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268	NC_015436	T	7	7	12293	12299	0 %	100 %	0 %	0 %	330835996
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270	NC_015436	ATG	2	6	12334	12339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835996
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273	NC_015436	TGA	2	6	12460	12465	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330835996
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373	NC_015436	TAT	2	6	16373	16378	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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395	NC_015436	TTG	2	6	17299	17304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	330835999
396	NC_015436	T	6	6	17352	17357	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
397	NC_015436	GGT	2	6	17386	17391	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
398	NC_015436	AT	3	6	17405	17410	50 %	50 %	0 %	0 %	330836000
399	NC_015436	TGA	3	9	17456	17464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836000
400	NC_015436	TGG	2	6	17547	17552	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836000
401	NC_015436	TCC	2	6	17594	17599	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	330836000
402	NC_015436	TTTC	2	8	17617	17624	0 %	75 %	0 %	25 %	330836000
403	NC_015436	ATG	2	6	17634	17639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836000
404	NC_015436	ATG	2	6	17677	17682	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836000
405	NC_015436	TA	3	6	17687	17692	50 %	50 %	0 %	0 %	330836000
406	NC_015436	A	7	7	17719	17725	100 %	0 %	0 %	0 %	330836000
407	NC_015436	AT	3	6	17752	17757	50 %	50 %	0 %	0 %	330836000
408	NC_015436	TTC	2	6	17783	17788	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	330836000
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428	NC_015436	ATT	2	6	19077	19082	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	330836001
429	NC_015436	TGA	2	6	19111	19116	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836001
430	NC_015436	TGG	2	6	19118	19123	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	330836001
431	NC_015436	GT	3	6	19130	19135	0 %	50 %	50 %	0 %	330836001
432	NC_015436	GAT	2	6	19204	19209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836001
433	NC_015436	CAT	2	6	19255	19260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	330836001
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435	NC_015436	TGA	2	6	19312	19317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	330836001
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454	NC_015436	AAT	2	6	20140	20145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	330836001
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